นายอิวายะ ทาเกชิ รมว.กต.ญี่ปุ่น แถลงเมื่อ 29 ก.ค.68 ว่า รัฐบาลญี่ปุ่นยินดีที่กัมพูชาและไทยบรรลุข้อตกลงหยุดยิงทันทีและปราศจากเงื่อนไข พร้อมชื่นชมการดำเนินการทางการทูตของทุกฝ่ายที่เกี่ยวข้องที่ช่วยผลักดันให้มีการบรรลุข้อตกลงดังกล่าว รวมถึงมาเลเซียที่เป็นเจ้าภาพจัดการประชุมพิเศษ และสหรัฐฯ ที่เป็นผู้ร่วมจัดการประชุม โดยญี่ปุ่นจะร่วมกับประเทศที่เกี่ยวข้องในการส่งเสริมให้กัมพูชาและไทยปฏิบัติตามข้อตกลงหยุดยิงและลดความตึงเครียดของสถานการณ์ต่อไป ก่อนหน้านี้ ญี่ปุ่นได้พยายามโน้มน้าวให้กัมพูชาและไทยลดความตึงเครียดของสถานการณ์ เนื่องจากเห็นว่าความสัมพันธ์อันดีระหว่างกัมพูชากับไทยเป็นปัจจัยสำคัญต่อสันติภาพและเสถียรภาพของภูมิภาค